ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه‌های مخمری عامل شانکر درختان میوه هسته‌دار در برخی از استان‌های مرکزی ایران

چکیده شانکر یکی از خسارت‌زاترین بیماری‌های درختان میوه هسته‌دار است که سبب ایجاد زخم‌های فرورفته تیره رنگ همراه با تراوش صمغ بر روی سرشاخه‌ها، شاخه‌ها و تنه درختان آلوده می شود. بیماری از مناطق مختلفی از ایران گزارش شده و نشان داده شده است که عمدتا توسط Pseudomonas   syringae   pv.  syringaeو در موارد کمتری به وسیلهXanthomonas   arboricola  pv.  pruniایجاد می شود. برای ارزیابی پراکندگی عوامل بیماری، نمونه‌هایی از درختان آلوده باغ‌های استان‌های اصفهان، چهارمحال و بختیاری، قم و یزد جمع‌آوری گردید. بخش‌های دارای علائم شاخه‌ها پس از ضد عفونی سطحی، در آب مقطر استریل خرد شده و سوسپانسیون به دست آمده روی محیط آگار غذایی حاوی سوکروز کشت گردید. کلونی‌های غالب روی محیط یاد شده برجسته، سفید مایل به خاکستری و خمیری شکل بودند. بیماریزایی نماینده‌هایی از جدایه‌ها روی نهال‌های هلو (Prunus persica) به اثبات رسید. DNA ژنومی از نماینده‌ها استخراج و قطعه‌ای از ژن RNA ریبوزومی 26S آن‌ها با PCR تکثیر و توالی‌یابی گردید. مقایسه توالی این ناحیه با توالی‌های مشابه در ژن بانک نشانگر تشابه بالای آن‌ها با گونه‌های Cryptococcus بود. تنوع ژنتیکی بیست و هفت جدایه به دست آمده با یکدیگر و با دو جدایه مرجع Cryptococcus adeliensisوC. magnus با به کارگیری آغازگرهای ERIC، BOX و REP بررسی شد. در دندروگرام رسم شده بر پایه تجمیع نتایج حاصل از سه نشانگر، جدایه‌ها در سطح تشابه 30% در 12 گروه قرار گرفتند. نتایج نشانگر وجود تنوع قابل توجه در بین جدایه‌های عامل شانکر درختان میوه هسته‌دار در مناطق مرکزی ایران است..